Trieste Ulusal Araştırma Konseyi'nin (Cnr-Iom) Istituto Officina dei Materiali'si tarafından yürütülen bilimsel bir araştırma, hücresel düzenlemedeki önemli bir süreci açıklığa kavuşturdu ve Rho GTPaz ailesi proteinlerinin hücre iskeleti, hareket ve hücresel iletişimi koordine etme işlevlerini yerine getirdikten sonra nasıl devre dışı bırakıldığını açıkladı.
Bilim adamları Angela Parise ve Alessandra Magistrato tarafından koordine edilen ve Journal of the American Chemical Society'de yayınlanan araştırma, bu gerçekleri analiz etti. Değişiklikleri tümör oluşumları ve metastazlar da dahil olmak üzere çeşitli patolojilerin gelişimiyle bağlantılı olan moleküler anahtarlar. Ekip, klasik moleküler dinamiği ve kuantum yöntemlerini birleştiren gelişmiş hesaplamalı simülasyonlar aracılığıyla, RhoA proteininin aktif konfigürasyondan inaktif konfigürasyona geçişini atomik seviyede gözlemledi.
Araştırmanın ilk yazarı Angela Parise şu yorumu yaptı: “Çalışma daha önce bilinmeyen bir mekanizmayı tanımladı. Reaksiyon sırasında, proteinin aktif bölgesinde bulunan bir amino asit olan glutamin, geçici olarak yapısını değiştirerek protonları aktaran ve kimyasal reaksiyonu mümkün kılan bir tür mekik görevi görür. Sürecin sonunda su moleküllerinin girişi, proteinin ilk konfigürasyonuna dönmesine ve yeni bir aktivite döngüsüne hazır olmasına olanak tanır. Bu model, Rho GTPases'in işleyişi konusunda yıllardır açık olan bir tartışmayı çözmektedir.“.
Atomik adımların doğrudan gözlemlenmesi, moleküler süreçlerin anlaşılması ve gelecekteki terapötik müdahalelerin tasarlanması için yeni perspektifler açar.. Araştırma müdürü Alessandra Magistrato'nun belirttiği gibi: “Reaksiyon sırasında atomların hareketini takip edebilme imkanı, proteinin kendisini nasıl devre dışı bırakıp yeni bir döngüye hazır hale geldiğini anlamamızı sağladı. Bu, hücresel fonksiyonların düzenlenmesinde rol oynayan diğer birçok proteinin incelenmesine de uygulanabilecek bir yaklaşımdır.“, patolojik süreçlerin ve farmakolojik stratejilerin incelenmesinde hesaplamalı metodolojilerin rolünü doğruluyor.
Bir yanıt yazın