Tıp bilişimi girişimi: Gerçek sağlık verilerinin oluşturulmasından kullanılmasına

On yıl boyunca Tıp Bilişimi Girişimi (MII) öncelikle temelleri oluşturdu: standartlar, veri entegrasyon merkezleri, portallar ve süreçler. Berlin'deki yıldönümü sempozyumunda girişimin belirleyici bir aşamaya girdiği açıkça ortaya çıktı. Altyapı mevcut; artık bunun araştırma ve tedarik için somut uygulamalarla sonuçlanacağını göstermesi gerekiyor. Kardiyoloji, onkoloji, ilaç tedavisi güvenliği ve yapay zeka projelerinin ilk sonuçlarını sunduğu ilk uzman oturumunun konusu da tam olarak buydu.

Odak noktası artık veri odalarının inşası değil, bunların pratik kullanımıydı. MII'nin ne kadar ilerlediği, “yapılandırılmış klinik dokümantasyon ve biyosinyallerden türetilen fenotiplerin sentezi yoluyla kardiyovasküler risk tanımlamasını iyileştirmeyi” amaçlayan bir proje olan ACRIBiS tarafından ortaya konuldu. Proje doğrudan klinik dokümantasyonu ele alıyor, rutin verileri kaynağında standartlaştırıyor ve bunları EKG gibi biyosinyallerle birleştiriyor. Kohorta halihazırda 3.800'den fazla hasta dahil edildi ve 5.000'den fazlasının bunu yapması bekleniyor. Bonn Üniversite Hastanesi'nden proje koordinatörü Prof. Sven Zenker şunları söyledi: “Daha yapacak çok işimiz var.” Diğer şeylerin yanı sıra, proje halihazırda standartlaştırılmış bir biyosinyal altyapısı kullanıyor ve modern yapay zeka modelleri değiştirilebiliyor. Zenker'e göre veri setinin yeniden kullanılmasına yönelik uluslararası bir ilgi halihazırda var.

“Entegre ATMP” (İleri Tedavi Tıbbi Ürünü) projesi, teorik birlikte çalışabilirlik ile gerçek sağlık hizmetleri uygulamaları arasındaki farkın hala ne kadar büyük olabileceğini açıkça ortaya koydu. Heidelberg projesi, gen ve hücre tedavileri gibi yeni tedavilere yönelik ilaçlarla ilgileniyor. Heidelberg Üniversitesi Hastanesi'nden Prof. Andreas Ziegler'e göre, güvenlik olaylarının birkaç kez ve bazen de kağıt üzerinde rapor edilmesi gerekiyordu. Bu nedenle proje, MII altyapısı ve veri entegrasyon merkezleriyle yakın bağlantılarla rutin verileri, kayıtları ve hasta iletişimini ortak bir yapıda bir araya getirmeye çalışıyor. Hastalar ayrıca bir uygulama yapısı ve bir TI mesajlaşma aracı aracılığıyla daha yakından dahil edilmelidir. Aynı zamanda, bu tür modellerin yalnızca finansman ve ücretlendirme konularının erken bir aşamada dikkate alınması durumunda uzun vadede işe yarayacağı da ortaya çıktı.

Bayer ilaç firmasından Dr. Christian Müller, endüstriyel veri kullanıcısının bakış açısını getirdi. Kendini “Bayer'de eczacı, avcı ve veri toplayıcı” olarak tanıttı ve Sağlık Araştırma Veri Merkezi (FDZ) ile Sağlık Araştırma Veri Portalı'ndan (FDPG) alınan verileri pratik olarak karşılaştıran bir çalışma olan “Veri İçgörüsü”nü açıkladı. Müller açıkça bunun “iki kaydı birbiriyle karşılaştırma amacını taşıyan veri içgörü çalışması” ile ilgili olduğunu söyledi. İçerik, oftalmolojik endikasyonlarda yaygınlık, insidans, ilaç değişiklikleri, sonuçlar ve bölgesel bakım kalıpları ile ilgili olmakla birlikte, aynı zamanda günümüzde veri kullanımının gerçekte ne kadar karmaşık ve güvenilir olduğu sorusuyla da ilgilidir.

Müller, MII'nin bir sonraki aşaması için merkezi öneme sahip olması muhtemel noktalara değindi. “Parmağını yaraya sokmak” istiyordu ve erişimin kullanıcının bakış açısına göre karmaşık olduğunu tanımladı. Portal her ne kadar “müşteriye tek yüz” olarak tasarlansa da pratikte “sanki her merkez kendi çıkarlarını gözetmeye çalışıyor” gibi görünüyor. Bu “gerçekten anlaşılır değil” ve “gerçekten müşteri dostu da değil”. MII çevresi eleştiriyi reddetmedi, aksine bunu devam eden bir başlangıç ​​aşamasının göstergesi olarak anladı. Süreçlerin yalnızca gerçek kullanım koşulları altında test edileceği ve daha da geliştirileceği bir “yükseltme aşaması” hakkında tekrar tekrar konuşuldu.

Veri entegrasyon merkezleri

Çeşitli üniversiteler ayrıca veri entegrasyon merkezleri sundu; Hamburg-Eppendorf Üniversite Hastanesi'nden (UKE) Dr. Jan Erik Rifle, sözde bir “veri oteli” inşa ediyor. Bu, araştırmacıların takma ad verilmiş verileri doğrudan yerinde analiz edebileceği güvenli bir işleme ortamıdır. Bu durumda veriler Jupyter not defteri ortamında sağlanır; Diğerlerinin yanı sıra Python, R ve Julia değerlendirmeye açıktır. Her veri odası projeye özel olarak tasarlanmıştır ve kendi takma adını alır. Pistole aynı zamanda ortamın başlangıçta hipotezlerin üretilmesine yardımcı olması gerektiğini de açıkça ortaya koydu. Veriler sistemden kolayca dışarı aktarılamaz.

Jena'daki Veri Entegrasyon Merkezi (DIZ) de kendisini bakım, araştırma ve endüstri arasında bir bağlantı olarak sundu. Orada, birlikte çalışabilirlik ve temel veri setlerinin yalnızca araştırma amacıyla değil, aynı zamanda sağlık hizmetleri süreçlerine mümkün olduğunca yakın bir şekilde uygulanması için girişimlerde bulunuluyor. Danny Ammon, FHIR ve terminoloji sunucuları gibi endüstriyel bileşenlerin de artık bu amaçla kullanıldığını açıkladı. ETL yolları (Çıkarma, Dönüştürme, Yükleme), spesifikasyonların tamamen geliştirildiği üreticilere verilir.

Heidelberg ise bir DIZ kurmanın pratik sorunlarını bildirdi. 250'den fazla kaynak sistemi, kağıt üzerinde bazı veriler, birincil sistemlere çok sayıda doğrudan erişim ve ETL rotalarının oluşturulması, veri yönetimi ve kalite güvencesi konusunda önemli miktarda çaba vardır. Dr. Angela Merzweiler, her yeni projeyle birlikte yeni veri akışlarının ve yeni gereksinimlerin geldiğini açıkça belirtti.

Kişiselleştirilmiş onkoloji

PM4Onco ayrıca MII'nin artık kişiselleştirilmiş onkoloji üzerinde ne kadar güçlü bir etkiye sahip olduğunu da gösterdi. Proje, tümör dokümantasyonundan, moleküler tümör kurullarından, patolojiden ve hasta anketlerinden elde edilen verileri birleştiriyor. Amaç, terapi kararlarını daha iyi değerlendirmek ve bunları farklı lokasyonlarda kullanılabilir hale getirmektir. Proje yöneticisi Melanie Börries şunu vurguladı: “Bizim için odak noktası her zaman hastadır.” Bu nedenle gereklilik, saf veri uyumlaştırmasının ötesine geçmektedir: yapılar, klinik kararları gerçekten destekleyebilecek şekilde inşa edilmelidir. Buna kanser kayıt verileriyle daha yakın bağlantılar da dahildir.

“Interpolar”ın (BT destekli müdahaleler için bir platform olarak olağan bakım) bakım uygulamalarıyla doğrudan bağlantısı vardır. Projenin, yatan hasta bakımında uyuşturucuya bağlı sorunların ve kontrendikasyonların, etkileşimlerin ve dozaj hatalarının erken aşamada görünür hale getirilmesine yardımcı olması amaçlanıyor. Leipzig Üniversitesi'nden Dr. Daniel Neumann, “Rutin bakımdaki kör noktayı ölçülebilir hale getirmek istiyoruz” diyor.

GeMTeX, yapay zeka uygulamaları için bir yapı taşı sağlar. Proje, yapay zeka tabanlı dil işleme için geniş bir klinik metin külliyatı oluşturacak. Almanya'da bugüne kadar gerçek, yeterince hazırlanmış klinik metin verileri büyük ölçüde eksiktir. TUM'dan Justin Hofenbitzer bunu “Almanya'da büyük bir delik” olarak nitelendirdi. GeMTeX'in bu açığı, bireyler, açıklamalar ve daha sonra FDPG aracılığıyla sağlanması hakkında herhangi bir sonuca varılmasına izin vermeyen takma ad verilmiş belgelerle kapatması amaçlanmaktadır.

Çeşitli katkılarda ve son tartışmada şirketlerin artık MII altyapısını verilere anlamlı erişim olarak algıladıkları açıkça ortaya çıktı. Daha erken ve daha sistematik bir şekilde dahil olmak istiyorlar. ID Berlin'in eş genel müdürü André Sander, “sektörde halihazırda mevcut olan çözümlerden daha fazla yararlanmak” istiyor. Örnek olarak Interopolar projesini gösterdi. Sanders'a göre bu izlenim “Almanya'da yatarak tedavi gören hastaların körü körüne uçması gibi” bir izlenim uyandırdı. Mevcut sistemlere atıfta bulunarak bununla çelişiyordu. Örneğin, “UKE […] “Tıp bilişimi girişiminden bir yıl önce ilaç çözümünü sunmaya başladık.” Sander ayrıca MII ile olan önceki deneyimlerine de değindi. Çalışmalar için hasta gruplarını hızlı bir şekilde belirlemek amacıyla kliniklerden ve sağlık kuruluşlarından gerçek dünya verilerini bir araya getiren bir platform olan TriNetX Europe'tan Mehmet Akyüz, kendi görüşüne göre endüstri ve sağlık hizmetleri lokasyonları arasındaki işbirliğinin daha erken, ideal olarak proje başlangıç ​​aşamasında başlayabileceğini ekledi.

İşletme ve bilim arasındaki işbirliği

Ağ bağlantılı tıbbi araştırmalara yönelik teknoloji ve yöntemler platformunun genel müdürü Sebastian C. Semler, endüstriyle daha yakın işbirliğinin yalnızca içerik açısından arzu edilmediğini, aynı zamanda finansman açısından da sıklıkla engellerle karşılaşıldığını doğruladı. Finansmana tam olarak uygun olmayan şirketlerin taşeronluk yoluyla projelerin finansmanına dahil edilmesi halen zordur; Buna “tüm rekabet hukuku engelleri” de eklendi. Eğer toplum gerçekten bilim ve iş dünyasının birlikte daha yakın çalışmasını istiyorsa, “bu prosedürlere yeniden ceza vermemiz” gerekiyor.

Sempozyumdaki bir başka panelde bireysel uygulama projelerinin ötesine geçen yapısal bir sorun tespit edildi: Her bilimsel fikir sağlık alanında daha da geliştirilmiyor. Klinik Araştırmalar Koordinasyon Ofisi'nden (KKS Networks eV) Dr. Susen Burock'a göre, genç ve kararlı araştırmacılar genellikle denemek ve bir makaleye kaydetmek istedikleri bir fikirle geliyorlar. Bu insanlar üniversiteden ayrıldığında, daha fazla gelişme genellikle durur. Bu kesinlikle MII'nin bir sonraki aşamasının temel zorluklarından biridir; bireysel projeler ve yayınlar dayanıklı, kalıcı olarak kullanılabilir çözümler haline gelmelidir.

(mack)